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摘要： 　　　　把生命数据化　　把生命数据化，让每一个人通过一个平台可以或许欣赏本身的各种生命数据，包罗基因组数据、医疗记录数据、生理数据等差别维度的数据。这个海量的生命解...

　　把生命数据化

　　把生命数据化，让每一个人通过一个平台可以或许 欣赏 本身 的各种生命数据，包罗 基因组数据、医疗记录 数据、生理数据等差别 维度的数据。这个海量的生命解码数据库，让医疗康健 变得更智能，并开启医学从“治疗”到“防备 ”的期间 。

　　这个可以或许 让生命进入数据化期间 的项目，便是“人类长命 公司”（Human Longevity, Inc., HLI）的任务 和愿景。而这家公司的掌门人，是大名鼎鼎 的克雷格?文特尔（J. Craig Venter）。

　　谈起这位名叫克雷格?文特尔的传怪杰 物，很多 人大概 会记得当 年塞雷拉基因组公司（Celera）的首创 人。众所周知，人类基因组筹划 是由美国科学家在1985年率先提出，于1990年正式启动。中国是在9年以后（1999年9月）才参加 到这项研究筹划 中，负担 此中 1%的任务 。此中 代表中国参加 的华大基因，则是由杨焕明、于军、汪建等人首创 创建 。

　　这位特立独行的文特尔，就在人类基因组筹划 启动8年后（1998年），创建了塞雷拉基因组公司（Celera），同时向人类基因组筹划 提出挑衅 。他宣称本身 的公司比这个由“连合 国”构成 的国际性项目还要快4年完成人类基因组测序。而这个公司的名字Celera一词，在拉丁语中意为“快速的”。

　　云云 痴迷于明白 生命的文特尔，在他的自传《解码生命》（A Life Decoded）内里 曾经提到过本身 对于解码生命的执着泉源 于想竣事 生命的想法。在如许 疯狂的想法下，这位集天才企业家和疯狂科学家于一生的文特尔，把当时 人类基因组筹划 推到了和民营企业竞争的位置。

　　然而，末了 的赢家却是科学。两个机构的竞争将人类基因组筹划 的完成时间提前了数年。文特尔的公司测得的基因组，着实 绝大部分 就是文特尔本人。为了更快、更好地完成任务 ，人类基因筹划 组不得不与Celera公司相助 ，采取 文特尔更为先辈 的测序技能 ，并与文特尔共同分享结果 。

　　文特尔通过贸易 的本领 推动了科学的发展，打下了一场美丽 的仗，然而却付出极大的代价。2015年，《天然 》（Nature）上的批评 文章《人类基因组筹划 ：大生物学的二十五年》（Human Genome Project: twenty-five years of big biology）完全没有提到文特尔的名字。这篇文章的作者包罗 现已成为美国国立卫生研究院（NIH）的主席的柯林斯、因发现 DNA 双螺旋布局 而享誉环球 的詹姆斯?沃森（James Watson），后者曾公开将文特尔比作希特勒。在人类基因组筹划 竞争赛竣事 以后，文特尔被公司开除 。

　　把生命应用化

　　之后的文特尔履历 了职业生活 的低谷。他本身 以为 ：“我很早就明白 ，人生最糟的事莫过于失去生命，冒险和遭遇波折 是让人进步 的一部分 。我常常 开顽笑 说，我懂的多是由于 犯的错误多。眼光放长远 也很紧张 。”在他的新书《光速生存 》内里 ，文特尔提到“我们在首个合成细胞问世的过程中，碰到 的种种困难。当局 通常不肯 赞助这类研究，由于 办理 此中 题目 必要 花很长时间，我也曾猜疑 本身 无法说服实行 委员会，让他们信托 这些题目 终将办理 。但我不停 坚信它们会被办理 ，惟有乐成 能证明 统统 。”

　　这内里 的提到的合成细胞，便是让文特尔东山再起的一家公司：“合成基因组公司”（Synthetic Genomics,Inc.,SGI）。这家公司试图明白 并重写生命的根本 原理，想要创造出可以或许 生产燃料、化合物以及药物的新型有机体。让生命数据化假如 是文特尔明白 生命的开始，那么合成生命便是他将生命数据应用化的开端。

　　合成基因组公司（SGI）是从文特尔研究所（The J. Craig Venter Institute, JCVI）剥离出来的子公司，创建 于2005年。这家以文特尔名字定名 的研究所，背后的故事也是颇有传奇色彩。

　　话说当年的人类基因组比赛 让文特尔闻名 天下 ，背后的“金主”着实 是帕金·埃尔默公司（PerkinElmer）。这家天下 上最大的分析仪器生产制造商，正是在文特尔“将人类基因组图谱申请成专利，把持 人类基因组信息谋利”的答应 下，注入3.3亿美金巨额让其创建 了Celera公司。

　　在资源 的推动下，文特尔领导 的团队不绝 赶超当时 的“国家队”，在基因组研究方面取得一个又一个突破。完全打乱了原有的人类基因组筹划 ，使得当时 任该筹划 的主席沃森（1953年沃森和克里克发现DNA双螺旋布局 ，厥后 因此成绩 共同得到 诺贝尔奖）不得不告急 弗朗西斯·科林斯（如今 弗朗西斯·科林斯已经是美国NIH的主席）。2000年4月，弗朗西斯·科林斯打电话给美国能源部负责引导 “人类基因组筹划 ”的科学家帕特里诺斯，向他分析了基因组破译的形势，发起 由当局 出头 来告竣 私家 公司和公共研究机构的息争 。以后 几个月，科林斯和文特尔开始机密 打仗 ，两边 讨价还价，吵的不可开交。克林顿总统也参与 此事，给科学顾问尼尔·雷恩写了一个简短的指令：“安排一下，让这些家伙携起手来。”终极 文特尔放弃了申请专利的要求，两边 告竣 息争 。

　　2000年6月26日，时任美国总统饿克林顿在白宫谨慎 公布 人类基因组筹划 草图的完成。当时 站在克林顿身边的两位科学家，一位是代表当局 的弗朗西斯·科林斯，另一位则是当局 不得不约请 的克雷格·文特尔。

　　文特尔放弃申请专利的消息，让Celera公司的股票江河日下 。Celera公司连续 两年处于策划 窘境 之中。2002年1月，公司董事会投票，同等 同意将文特尔开除。夜深人静，传怪杰 物文特尔静静 溜进公司的办公室，将本身 的东西摒挡 好，扫兴 地离开 了由本身 一手创建 的Celera公司。

　　感情 低沉 的文特尔曾一度想到自尽 ，他躲在本身 的游艇内和客人说：“我大概 会自尽 ，纵然 不自尽 ，也要抱病 而死。”他实行 通过购物转移本身 的失落感情 ，购买了一栋代价 500万美金的别墅，而且 带有2.75米高人工瀑布的美丽 泳池。每天 文特尔在别墅内可以或许 喝着咖啡俯瞰加勒比海。如许 的生存 连续 了几个月，文特尔又重出江湖。他做的第一件事变 ，就是创建 克雷格·文特尔科学基金会，将本身 从Celera公司分到的1亿多美金捐给了基金会。

　　基金会的创建 ，让文特尔看到了新的抱负 ：创造新的生命情势 。让“生命数据化”假如 是文特尔将科学“贸易 化”的第一场战役 ，那么“生命应用化”将是他重出江湖的第二场战役 。

　　如今 ，文特尔的合成基因组公司已经将合成细菌细胞升级到更复杂的人体细胞上。为了让人类可以或许 受益于这种合成技能 ，文特尔提出从改造猪的基因组开始，让猪的器官具备人类器官的特性 ，他说，“我们在改写猪的基因组，让猪的器官可以用于人类器官移植。”

　　不但 仅是“全基因组检测服务”

　　任何不以红利 为目标 的贸易 模式都是耍地痞 。对于克雷格?文特尔创办 的企业来说也绝不 例外 。在文特尔被本身 创办 的Celera基因组公司开除 以后，他不停 运营着一家非营利构造 （文特尔研究所）和两家生物科技公司（Synthetic Genomics和Human Longevity）。

　　从已往 的履历 中文特尔学到了足以影响他一生办事 风格的履历 ：将科学“贸易 化”。他在一次采访中说到：“二战前，科学研究多数 受到私企和慈善机构资助。之后我们迎来了美国当局 大量资助科研的黄金期。但是如今 从比例上来说，当局 基金对科学项目标 资助可以用惨淡 来形容，政策也在限定 创造力，以是 贸易 才是推动科学发展的途径之一。贸易 是目标 还是 结果 并无区别，由于 科学要想影响社会，就必须能带来经济收益，比如 说，药物必须有效 和具有可及性。当当局 表现 令人扫兴 时，私家 投资是包管 科学不绝 突破的一种方法。“

　　这段话也答复 了当初文特尔作为初出茅庐的企业家跨入商界，和由当局 主导的人类基因组筹划 睁开 竞争，这背后所持有的代价 观。无论众人 怎样 对待 文特尔将科学“贸易 化“的办事 风格，如今 追念 起来：“人类基因组筹划 原来 预计历时15年，预算达50亿美元。而一个小团队能用不到15年的时间，仅耗费 前者预算的一小部分 就完成了该项目”，不得不说文特尔是将科学“贸易 化”的奇才。

　　“左手”组建文特尔研究院，“右手”创办 生物科技公司。这位疯狂的企业家书 奉当代 实行 生理学首创 人克劳德?纳德（Bernard Claude）的一句格言：艺术是本身 的，科学则是各人 的（Art is I，Science is we）。用“科学”来收揽人才，用“企业”来实现长处 ，作为科学家“下海”的文特尔，深知和科学家相助 的法门 ，他的见解 是：“我以为 长远 来看，人们可以或许 在我创造的环境 中不绝 进步，部分 缘故起因 是我们没有设终身职位。我们不像当局 机构或高校，不会用这种嘉奖 让一些人过早放弃奋斗。我们都知道，逾越 昨天的本身 才是正道。真正良好 的人不会为得到 安全感而奋斗，他们奋斗的动力是在学术上取得突破。”

　　2013年年末，文特尔和别的 两位合资 人（Peter Diamandis和Robert Hariri）共同创建 了“人类长命 公司”（Human Longevity, Inc., HLI），初志 是为了创建 天下 最大的人类遗传和医学信息数据库（类比中国发改委依托深圳华大基因研究院组建的国家基因库），进而实现把生命数据化，终极 让人类寿命向三位数延伸。

　　2014年上半年，Human Longevity公司得到 了8000万美金的A轮融资。2016年4月4日，Human Longevity公司完成发行总代价 高出 2.2亿美金的B轮优先股。参加 这轮融资的投资方包罗 Illumina公司，Celgene公司，GE公司以及部分 A轮融资的投资者。除了美国投资者，尚有 部分 投资人来自英国、马来西亚、墨西哥、澳大利亚、科威特、中国大陆以及香港。

　　有了“粮食弹药”的Human Longevity公司，开始了一系列将“生命数据化”的举措 。

　　2015年10月，Human Longevity公司在总部开放了一个称为“Health Nucleus“的中心 。这是天下 上一个将基因组数据和康健 数据连合 起来的中心 ，客户不但 可以或许 得到全基因组测序数据，还可以或许 得到肠道微生物测序数据、生理数据、解剖 数据和举动 数据等各个维度的生命数据。这一系列通过非侵入式的检测，大概 正是文特尔提出来将生命数据化的第一步，他信托 这些检测可以或许 改善人类的康健 ，可以或许 对人类康健 举行 管理。

　　为了将来 这些数据都可以或许 和大量的医学信息连合 起来，文特尔起首 让Human Longevity公司变成 天下 上最大的人类基因测序机构，从Illumina公司那边 买来了24台新型的HiSeq X测序仪（国内只有诺禾致源可以或许 和Human Longevity公司的测序本领 相匹配），成为了Illumina最大的客户。

　　光有测序本领 是远远不敷 的。就在Human Longevity公司得到 A轮融资的第二年，文特尔就公布 收购生物标记 物开辟 企业Cypher Genomics。这家被收购的公司重要 是提供人类基因组分析软件，此中 的主打产物 Mantis软件是用来表明 基因组测序数据，以辨认 临床上明显 的变异。别的 ，该公司还开辟 了一款发现生物标记 物的产物 ，叫做Cypher's Coral?。这家公司同时也是英国10万基因组筹划 中的生物信息分析提供商。Human Longevity公司通过对Cypher Genomics的收购，将其14名员工收编旗下，包罗 连合 首创 人兼CEO Ashley Van Zeeland，这位前CEO将领衔Human Longevity公司的儿童基因组业务。

　　这家已经融资近3亿美金的公司，如今 已经积聚 了高出 2万个基因组及表型数据，创建 了以基因组研究为导向的康健 研究中心 ，开始网络 已有基因组数据志愿者的生理康健 信息。文特尔的目标 是在2020年前得到 100万例生理康健 记录 。这些数据都可以或许 成绩 文特尔创建 起天下 上最大、最完备 的生物信息数据库，这些信息转化成知识库的本领 ，也是文特尔公司具备的本领 。全部 这些，都让文特尔的公司不但 仅只提供“全基因组测序服务”，而且可以或许 提供“全基因组康健 管理”（国内奇云诺德也是首家提供雷同 的全基因组康健 管理服务）。如今 ”Health Nucleus“的整套康健 管理服务售价是25,000美金。随着参加 者不绝 购买参加 ，数据库和服务内容都在不绝 更新升级，文特尔寻求 “永生 不老”的旅途也答应 以或许 找到一些答案。

　　打造环球 范围的“康健 俱乐部”

　　文特尔在奇点大学的医学集会 会议 上表现 ，如今 基因组学的发展仍旧 停顿 在数量 上的扩张，这是一件令人遗憾的事变 。假如 我们看看克制 如今 的基因组数据，就会发现环球 范围内已经完成了高出 22.5万个基因组测序数据。文特尔估计在2020年这个数量 将到达 500万。

　　假如 说基因组数据的发作 带来生命期间 的开端，那么在这个数据游戏的背后，赚的盆满钵满当属美国Illumina公司。这家出售基因测序仪器的公司，占据着环球 高出 一半的基因测序装备 市场。从艾瑞整理公开数据表现 ，如今 共有7389台基因检测装备 ，分布在60多个国家中，此中 Illumina公司就占了83.9%，剩下的由Thermo Fisher公司占9.9%，Roche公司占5.3%。可以说美国企业在环球 把持 了高出 九成的市场。中国的企业，则是这些公司最大的买家。

　　2012光阴 大基因的样本数量 占环球 检测总数的比例达50%，很洪流 平 上得益于Illumina公司源源不绝 提供其“测序武器”。固然 华大基因如今 已经具备了生产这种“测序武器”的本领 （通过收购美国一家面对 倒闭的测序装备 公司Complete Genomics），但是Illumina公司在提供”武力“给中国企业上面并没有很大的偏好。

　　资源 毕竟 是逐利的。以“测序武器”为例，Illumina公司新型号测序仪HiSeq X Ten，在数据产出服从 上是旧型号测序仪HiSeq 2000的12倍。这意味着华大基因最初购买的120多台，如今 任何企业只必要 购买一套HiSeq X Ten（一套10台）就具备划一 的“武力”了。而同样产出1G的数据，旧型号的测序仪必要 本钱 高出 200元/G，新型号只必要 60元/G。无怪乎各大购买了HiSeq X Ten装备 的企业，都宣称可以或许 实现1000美金测完一个人的全基因组数据。

　　克制 到2016年6月份，已经有八家中国企业购买了这套等同于120台HiSeq 2000测序仪的新型“测序武器”。从Illumina公开的数据来看，本年 第一季度HiSeq X-Ten的出货是20套，订单量高出 预期的20-30套。这内里 近一半是中国买家，无怪乎有人猜测 ，下一波的生命经济将会是中国引领天下 。此中 基因数据“生产工厂”的称呼 ，中国已经是“名副着实 ”。

　　基因数据的发作 ，带来的是卑鄙 数据分析财产 的崛起。特别 是生物信息技能 和互联网技能 的连合 ，带来了基因大数据和康健 大数据的交集。然而国家政策对于基因大数据崛起的影响，不停 以来都没有克制 过。2012年10月31日中国当局 网公布了《人类遗传资源管理条例（征求意见稿）》，假如 我们细致 研究条例的内容，可以或许 得到一个信息，国家开始对于人类遗传资源（含有人体基因组、基因及其产物的器官、构造 、细胞、核酸、核酸成品 等资源质料 及其产生的信息资料）开始举行 管制了。从2016年3月7日开始，这个管理条例渐渐 举行 实行 ，国家不但 对于基因样本资源会有规范，对于基因信息资源也会渐渐 出台相干 的政策。

　　这意味着，中国人的基因数据，必要 在中国境内和被中国企业举行 消化、转化和应用。我们的“测序武器”可以入口 ，“测序技能 ”可以入口 ，但是“测序数据”出境和发掘 却受到管制。这个基因大数据和互联网大数据相比，除了生物信息技能 的门槛以外，又蒙上了一层政策风险。

　　把生命数据化的下一位是谁？

　　文特尔声称：“如今 为止，我们可以或许 明白 的基因不到整个基因组的百分之一，但即便云云 ，我们所相识 的信息也非常宝贵 ，我们可以利用 这些信息开创新的防备 医学范式。现有的信息可以或许 资助 人们明白 他们的康健 风险，并有盼望 救济 很多 生命。”

　　然而，并不但 仅只有文特尔懂得这些基因信息的代价 地点 。美国各大互联网巨头也已经布局 生命数据化范畴 ，包罗 谷歌、IBM、微软和亚马逊等信息期间 的巨头。亚马逊的AWS云服务和基因行业的相助 可以不停 追溯到NCBI提供的环球 范围的基因信息比对搜刮 引擎。2012年，亚马逊的云服务已经担当 了国际千人基因组筹划 的基因数据存储，当时 这是天下 上最大的人类遗传学数据库，而且 数据是公开和免费的。

　　另一家书 息期间 的巨头，也在寂静 布局 这个范畴 。作为一家以搜刮 引擎发家的企业，谷歌每年在搜刮 范畴 的营收高出 了600亿美金。这种独特竞争力，让谷歌在进入生命科学范畴 的时间 ，看到了一样平常 传统医疗企业无法看到的关键点，那就是可被发掘 的基因大数据。

　　如今 ，谷歌已经开始说服科学家和大夫 将他们多年积聚 的基因数据上传到谷歌的云平台Google Genomics，每年的费用远远低于将这些数据留在本身 的私家 电脑。在生命科学范畴 上的实行 得到了长处 ，谷歌的野心也开始膨胀了，Project Calico提出要办理 人类朽迈 题目 ，延伸 人类的寿命，Baseline研究盼望 构建一个假造 的康健 人来为疾病的防备 和控制作为引导 ，癌症纳米检测顾名思义就是通过磁性纳米粒子来检测早期阶段的癌症。种种的项目，都表现 了互联网巨头对于生命科学范畴 日益器重 。

　　创建 Calico的初志 ，源于谷歌风投（Google Venture）的合资 人Bill Maris的想法。Maris曾观察过生命科学版图，发现没有一家专注于延伸 人类寿命的生物企业，而人类克制 不了朽迈 ，但是可以通过技能 延伸 我们的寿命。于是他找到了本身 谷歌的老板布林，厥后 布林找到合资 人佩奇，三人举行 了对话以后告竣 共识，让谷歌来赞助整个项目。在Maris找来Levinson征求意见让其保举 CEO人选时，当时 已经从基因泰克离职 的Levinson当场 表现 乐意 担当 Calico的CEO职位。就如许 ，Calico奠定 了富丽 的核心 团队阵容。为什么叫“Calico”呢？这个词语有多重意思， Calico表现 一种猫的毛色分类，此中 有三色的寄义 ，有的地方Calico也表现 一种冲锋枪，卡利科枪械系列的一种。Calico读起来有点像“California Life Co”的意思。据Calico公司的首创 人称，Calico的宗旨是延伸 人的寿命。假如 从猫具有九条命的寄义 来推测 ，Calico很像是取其“California Life Co”和猫的九命传奇连合 而生。由此看来，Calico这个名字和公司的目标 “让人类活得更长、更康健 ”是相称 的符合 。

　　我们来看看佩奇组建这家公司的团队都有哪些人：

　　苹果公司现任董事长Arthur Levinson担当 CEO，Levinson曾经是生物制药公司基因泰克（Genentech）CEO，同时也是罗氏公司的一名董事。作为Calico的CEO，Levinson可谓是一名传怪杰 物。现年已经65岁的他，身兼谷歌、苹果董事，同时也是基因泰克（Genetech）公司的董事会主席。曾经被冠名为生化科技范畴 的“美国最佳CEO”，在1995到2009年担当 基因泰克的CEO，期间他先是在2000年参加 苹果董事会，后在2004年到2009年间担当 谷歌董事。2009年基因泰克被罗氏收购，Levinson才公布 离职 。如今 Calico首批的核心 团队成员，也是Levinson从基因泰克带出来的骨干。

　　罗氏前首席医疗官Hal Barron担当 CTO，Barron作为2013年生物医药行业最具影响力的25人之一，也是他促成了罗氏和基因泰克联姻 ，堪称基因泰克领先基因的创造 者。

　　普林斯顿大学闻名 的遗传学传授 David Botstein担当 CSO（首席科学官），Botstein传授 曾经是普林斯顿大学Lewis-Sigler整合基因组学研究所前主任。

　　加利福尼亚大学的生物化学家Cynthia Kenyon担当 副总裁。除此以外，Levinson把基因泰克高级肿瘤学家Robert Cohen，UCSF抗朽迈 和遗传学范畴 的专家Cynthia Kenyon也招致麾下。

　　刚刚创建 的Calico非常的低调，但是脱手 的第一招就是大手笔。

　　2014年9月4日，Calico与制药巨头艾伯维在朽迈 疾病治疗范畴 告竣 相助 ，签约金额高达15亿美金。艾伯维公司在2013年从雅培剥离出来，仅仅是治疗类风湿性关节炎的药物Humira就为艾伯维公司每年贡献130亿美金。不足为奇 ，就在Calico和艾伯维签订 相助 的前后，艾伯维就以8.05亿美金收购Infinity制药旗下肿瘤药Duvelisib，Calico的东家谷歌公布 收购Lift Labs公司。Lift Labs专弟子 产一种高科技防抖勺，可以为帕金森病和其他雷同 的疾病患者提供便利。

　　从Calico的富丽 团队阵容和背后强大 的投资机构谷歌来看，很显然是预备 利用 起投资的23andMe公司（佩奇前妻创建 ）积聚 的基因数据，同时整合谷歌的大数据发掘 技能 来攻克人类朽迈 困难 。

　　生命的数据化并不是尽头 ，这仅仅只是出发点 。人类迄今为止无法正确 读懂基因暗码 中的信息。天生 基因数据并不是难事，最难的在于我们对于基因信息的明白 非常 匮乏。要明白 基因组和康健 的关系，明白 每个人之间在基因组上存在差别 的意义，尚有 很长的一段路要走。生命可以或许 被数据化，但是信息化和知识化的过程是云云 的滞后，不得不让我们思考 数据化存在背后的意义。